Narodil se v rodině významného chebského architekta Adama Haberzettla (1816-71). Se svým bratrem Carlem (1848-1906) vystudoval polytechniku ve Stuttgartu. Byl aktivním členem Stuttgartského akademického sdružení architektů Vitruvia. Po smrti otce převzal spolu s bratrem dobře zavedenou stavebně projekční kancelář.

Na konci osmdesátých let 19. století zcela propadl kouzlu fotografie. Od roku 1889 dokumentoval stavební proměnu města Chebu, ale i krajinu a přírodní krásy okolí. Se vznikem Chebského národopisného spolku, jehož idea mu byla blízká, se jeho námětem stal rozmanitý chebský venkov.

V roce 1900 se angažoval v založení chebského fotografického spolku Lichtbild-Verein Eger, jehož byl dlouholetým místopředsedou. Dokumentační hodnoty jeho fotografií si byl dobře vědom i Karel Siegl (1851-1943), který je zakoupil do chebského archivu a muzea. V roce 1928 bylo jeho osm převážně národopisných fotografií otisknuto v publikaci Unser Egerland im Bilde. Josef Haberzettl sám se této pocty nedožil, zemřel tři dny před 72. narozeninami.